江南大学附属医院药学部是国家卫健委临床药师培训基地、国家药品不良反应监测哨点联盟成员、无锡市卫健委“无锡市药学管理质控中心”组长单位、无锡市药师协会副会长单位。

药学部现有药学技术人员131人，其中高级职称20人，中级职称39人，硕博士人员25人，专科临床药师18人，拥有省“333”工程培养对象1名，省青年医学人才1名。

药学部担负着医院药学技术服务、药事管理、药品供应三大责任，负责全院中西药品和科研用药的采购、供应、调剂、制剂及静脉药物调配工作；负责药品进入医院以后的全程质量管理；承担培养药学专业硕士研究生、本科/大专生的教学实习任务和进修生的培训任务；进行临床药学和药学科研等领域的工作。

药学部承担临床试验机构管理工作，临床试验机构为国家药品监督管理局批准备案的临床试验中心，主要承担药物Ⅰ-Ⅳ期、人体药代动力学、生物等效性、医疗器械及体外诊断试剂等临床试验。机构现有药物临床试验专业19个，器械专业41个，各专业组技术力量雄厚、设施设备齐全、病源丰富，截至目前共承担并完成国内外药物临床试验169项、器械临床试验84项。

药学部于2014年8月成为国家临床药师培训基地，现有通科（糖尿病）、通科（慢性疼痛）、通科（慢性阻塞性肺疾病）、抗感染药物、抗肿瘤药物、心血管内科、内分泌7个带教专业，面向全国招生。2015年12月，药学部开展了血药浓度监测技术，目前涉及氟尿嘧啶、紫杉醇、多西他赛、甲氨喋呤、万古霉素等19种药物的检测；2019年药学部又开展了药物基因组学检测技术，涉及伊立替康、铂类药物、氯吡格雷和他汀类药物等16种药物的检测，为实施患者个体化药物治疗提供了平台。2019年12月成为国家药品不良反应监测哨点联盟成员。

药学部科研目标明确，在学科建设方面，以骨代谢疾病与分子药理学研究、个体化用药研究（血药浓度和基因检测）、药物治疗管理、医院药事管理为方向，机制探索与临床转化并重，服务于临床。近年来承担各级课题20余项，其中国家自然科学基金项目2项，省部级课题8项，无锡市成果转化与适宜技术推广项目2项，国家授权专利4项；获得了江苏省科学技术奖（三等奖）、江苏医学科技奖（三等奖）、江苏中医药科学技术奖（二等奖）、无锡市科学技术进步奖（三等奖）。每年主持召开省市级继续教育学习班。